邪電王國的希拉博士因為妒忌人類的超文明,於是向地球進行連串破壞行動。久保田博士下令健太、耕一祈、瞬、千裏和杏子變身成電磁戰隊百萬連者,進行對抗邪電的行動。其後,更出現了第六位戰士早川裕作,起初新戰士不太喜歡電磁戰隊,後來相處日子越多,感情越深厚。希拉更控制王者魔獸,打算與電磁戰隊同歸於盡。