在三年前某個晴朗的假日，還是初中生模樣的工藤新一正在公園大秀球技。這時，一個面帶憂郁的男子走過來，向他詢問3天前是否在公園看到一個男孩。新一搖頭否認，男人於是轉而詢問其他的人。此時新一卻發現，就在不遠的地方有兩個神秘之人密切觀察著他們。經進一步了解得知，那個男人名叫秋元宏一，在東京標準局工作，他被警察懷疑殺害了自己的奶奶，而他的供詞又漏洞百出，因此秋元才四處尋找能夠證明自己不在場的目擊證人。
經過新一的啟發，秋元記起曾有一白衣女子牽著黑色的狗經過他的身邊。以此為契機，新一和秋元開始尋找目擊證人…
