日本警視廳特殊部隊(SIT)小隊長瀨文焚流(加瀨亮 飾),在壹次執行任務時遭遇隊友的離奇死亡,面對高層他百口莫辯,最終被調職到公安部公安第五課——不明事件調查科。該部門專門調查壹些匪夷所思的超自然案件,當然在所謂“科學昌明”的現代化社會,這也意味著第五課是壹個很難得到認可的邊緣部門。除瀨文外,第五課只有油滑的上司野野村光太郎和智商高達201的怪女孩當麻紗綾(戶田惠梨香 飾)。在此期間,預言師、神之手等各種各樣擁有超能力(SPEC)的人物接連登場。
瀨文在和當麻辦案的過程中,漸漸趨近了壹個鮮為人知且充滿陰謀和秘密的未知世界……