在遙遠的未來，壹班時間罪犯進行非法行為使歷史也被錯亂修改，所以地球也成立了公共機關“時間保護局”，來監視這些非法篡改歷史的罪犯，並將他們用“冷凍壓縮”的刑罰繩之以法，這時“時間保護局”收到報告，在隆德監獄所有罪犯的手下假扮成守護者，趁被冷凍之際，則趁機 殺害所有的時間守護者，然後將隆德監獄據為己有，並組成了犯罪集團“洗錢幫”引誘時光機器進行時光旅行，時間設定為來到公元2000年的日本。
四位來自公元3000年的時間守護局成員優理、土門、綾瀨、席恩為追捕逃走的時間罪犯唐‧多尼洛與其“洗錢幫”的黨羽，與時間保護局戰隊隊長龍也來到壹千年前的二十世紀，但原來龍也隊長竟是洗錢幫的莉拉所假扮，加上時光機受到破壞暫時回不了未來世界，洗錢幫也開始為了金錢四處作惡，但是手上的五個時間變身器（Chrono changer）啟用時必須要有五名使用者同時起動，所以四人將誤打誤撞來到時光機墜毀的海灘，與龍也長相壹模壹樣的20世紀人淺見竜也拉進陣容中，開始了時間連者逮捕洗錢幫歸案的戰鬥。
其後淺見竜也為了擺脫家族帶來的困擾而離家，與四位未來人在東京都品川區的壹個房子住下來，成為時間連者的基地，又因脫離家族沒有經濟來源，所以成立了“TOMORROW RESEARCH”，開始做起萬事通（替委托人承擔各類工作）的生意。後來又出現了新的機器人與變身器，加上龍也的舊友瀧澤直人，也成了擁有與時間連者同等力量的競爭對手。但隨著局勢發展，龍也他們漸漸發現原來打從壹開始，就有意想不到的陰謀正在醞釀……
